将CAVATICA平台扩展到澳大利亚，可以对地理隔离和司法保护的数据资源进行协调分析

波士顿，2020年6月2日-七桥, 行业领先的生物信息生态系统提供商, 今天宣布与Gabriella Miller Kids First数据资源中心(Kids First DRC)建立合作伙伴关系。, 零儿童癌症(零), 儿童脑肿瘤组织联盟(CBTTC), 澳大利亚生物共享资源和澳大利亚研究数据共享资源(ARDC). 该跨国基因组癌症研究项目旨在建立国际联合计算基础设施，使澳大利亚ZERO的儿童癌症数据与CBTTC和儿童优先刚果民主共和国的广泛基因组数据集协调一致. 通过这次合作, 研究人员希望更好地了解罕见的小儿脑癌亚型，并改善对患者及其家属的干预措施.

大规模癌症全基因组测序(WGS), RNA-Seq和甲基组分析对k8彩乐园官方免费下载了解许多癌症产生了重大影响, 包括病因, 识别疾病亚型, 新的途径和新的药物靶点. 尽管全球范围内有许多广泛的基因组癌症研究项目, most focus on adult cancer; however, 由于所有高危儿科癌症亚型都是罕见病, 亚型与基因组变异之间的统计学显著相关性本质上依赖于大样本量.

“在澳大利亚，儿童癌症导致的死亡人数比其他任何疾病都多，每周都有三名儿童和青少年死于癌症,马克·考利说, Ph.D.儿童癌症研究所的副教授. “每个孩子都是不同的, 每种癌症都是独一无二的, 所以治疗必须为每个人量身定做. 通过儿童癌症亚型的国际数据合作, k8彩乐园官方免费下载希望更好地了解如何治疗k8彩乐园官方免费下载在澳大利亚发现的癌症, 基于之前无法获取的信息.”

研究将在CAVATICA平台上进行, 用于协作访问的基于云的系统, 分享和分析儿童癌症数据. CAVATICA平台，由 七桥, 允许世界各地的临床医生和科学家在计算和存储环境中快速访问大量基因组数据和工作流程, 过程, 整合和分析数据. Complex 而且 comparative analyses can be achieved using various open source R 而且 Python packages; 而且 through the Data Cruncher feature, 数据可以通过交互式Jupyter笔记本共享.

“CAVATICA平台使k8彩乐园官方免费下载能够无缝协作, 分享, 与其他研究儿童癌症的研究人员相互操作和联系, 推动改善的结果和新颖的研究,亚当·雷斯尼克说, Ph.D.，儿童第一数据资源首席研究员. “这个平台使k8彩乐园官方免费下载能够协调和处理超过15个,000个全基因组, 整个外显子体和RNA-seq, 包括对齐, 体细胞变异呼叫, 复制号码呼叫, 结构变异, RNA表达和融合. 另外, 与儿童优先数据资源中心门户网站的集成允许用户创建队列并安全地管理他们的分析, CAVATICA中的基于云的项目.”

使这种跨国合作成为可能, CAVATICA平台正在扩展，以实现跨地理隔离和司法保护的数据数据集的协调分析, 在澳大利亚和美国. 扩展的CAVATICA编排引擎将允许ZERO和Kids First工作流和分析工具在两个数据集之间互换和无缝使用. 从研究者的角度来看, 该平台将单独的数据集聚合为一个虚拟的泛大陆数据集，可通过全球最佳实践分析平台高度访问该数据集.

“通过CAVATICA平台将跨国界的儿科研究人员联系起来, k8彩乐园官方免费下载还通过使用全球标准的通用工作流语言(CWL)来打破数据孤岛之间的边界 多重云计算布兰迪·戴维斯-杜森贝里博士说.D.七桥的首席科学官. “这使k8彩乐园官方免费下载的研究人员能够专注于罕见癌症儿童的治疗，而不是数据挑战.”

关于七座桥
七座桥梁使研究人员能够从基因组和表型数据中提取有意义的见解，以推进精准医学. k8彩乐园官方免费下载完整的生物信息生态系统包括一个兼容的分析平台, 无缝数据和自动化, 以及专家科学服务. 这种生物信息学的整体方法使研究人员能够在世界领先的学术, 生物技术, 政府, 医疗中心, 和制药实体-增加R&D效率, 加强假设解析过程, 分离关键生物标志物, 甚至可以扭转失败的临床试验，同时减少计算工作流程时间和数据存储成本. 欲了解更多，请访问 sandersmerchandise.com 或者跟着k8彩乐园官方免费下载 LinkedIn 而且 推特.

关于加布里埃拉米勒儿童第一儿科研究项目数据资源中心
由美国国立卫生研究院共同基金支持的加布里埃尔·米勒儿童优先数据资源中心(Kids First DRC)是一项协作性的儿科研究工作，旨在加速数据驱动的发现，并利用大型基因组数据集为诊断患有癌症或结构性出生缺陷的儿童开发新的基于精确的方法. 儿童优先刚果民主共和国由综合核心团队组成，支持前沿大数据基础设施的开发，并为研究人员和临床医生提供必要的资源和工具.

这是共同基金加布里埃拉·米勒儿童第一儿科研究项目的一部分, 刚果民主共和国儿童优先组织被指控:

• 开发数据驱动的平台，整合来自不同疾病类型的大量基因组和临床数据.
• 增强协作发现能力, 订婚, 以及跨疾病群体的必要合作伙伴关系，这对k8彩乐园官方免费下载在生物学上理解疾病方面取得进展至关重要.
• 为诊断为儿童癌症或结构性出生缺陷的患者提供快速转化为个性化治疗.
• 加速发现遗传原因和共享的生物途径在这些条件内和跨.

关于儿童脑肿瘤组织联盟
儿童脑瘤组织联盟(CBTTC)的使命是为诊断患有脑瘤的儿童找到治疗方法并改进治疗方法. 为此目的, CBTTC收集高质量的脑肿瘤生物标本及相关临床资料，以促进生物标本的基因组分析. 培养细胞系，然后从肿瘤标本中创建可移植的肿瘤模型. 这些模型使研究人员能够与CBTTC其他成员机构和全球科学界分享他们的发现. CBTTC建立了一个协作的多机构组织和数据存储库，以收集和分析高质量的脑肿瘤标本. 除标本资料外, 该存储库还链接到临床数据，以提供每个独特肿瘤的全面快照.

另外, CBTTC致力于推进基于组织的研究, 使世界各地的研究人员能够获得脑瘤标本的分子分析. 这些举措将有助于改善脑瘤患者的治疗.

关于澳大利亚生物资源
澳大利亚生物commons正在通过协调和提供生物信息学和生物科学数据基础设施，为澳大利亚生命科学研究建设数字能力. 重点是积极参与研究社区, 正在与国际同行基础设施合作开发和维护共享数字基础设施. 澳大利亚生物共享资源公司正在定制提供复杂分析能力的服务, 包括软件和硬件两种平台. 培训和支持解决方案正在简化对数字技术的访问, 对环境至关重要的数据和工具, 农业和生物医学研究. 欲了解更多有关 澳大利亚BioCommons 或者跟着k8彩乐园官方免费下载 推特.

关于儿童癌症研究所
1976年，两位患有癌症儿童的父亲创办了这家公司, 儿童癌症研究所是澳大利亚唯一一家完全致力于研究病因的独立医学研究机构, 预防和治疗儿童癌症. 四十年后, k8彩乐园官方免费下载的愿景是拯救所有癌症儿童的生命，改善他们的长期健康, 通过研究. 该研究所现已发展壮大，拥有300多名研究人员, 操作人员及学生, 在科学上的卓越成就在国内和国际上享有盛誉. k8彩乐园官方免费下载的重点是翻译研究, k8彩乐园官方免费下载有一个由实验室研究人员和临床科学家组成的综合团队，他们合作发现新的治疗方法，这些治疗方法可以尽快从实验室的长凳上应用到k8彩乐园官方免费下载医院病房的儿童病床上. 这些新的治疗方法专门针对儿童癌症, 因此，k8彩乐园官方免费下载可以开发出更安全、更有效的药物和药物组合，将副作用降至最低，最终为患有癌症的儿童提供最好的治愈机会和最高的生活质量. 更多的在 www.ccia.org.au.

关于零儿童癌症(Zero)
“零癌症”项目由悉尼儿童医院的儿童癌症研究所和儿童癌症中心领导, 兰德威克汇集了澳大利亚所有主要的儿童癌症临床和研究小组，为患有高风险或复发性癌症的儿童提供澳大利亚首个个性化医疗项目.

关于澳大利亚研究数据共享
澳大利亚研究数据共享(ARDC)是一项转型倡议，使澳大利亚研究界和工业界能够获得具有国家意义的数据, 领先的数据密集型电子基础设施, 平台, 技能和高质量数据的收集. k8彩乐园官方免费下载的目的是通过数据为澳大利亚研究人员提供竞争优势. 欲了解更多信息，请访问 在线 或者跟着k8彩乐园官方免费下载 LinkedIn 而且 推特.

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埃里克·舒伯特
七座桥梁的抗震
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