协作
该平台是为分布式研究小组而设计的. 因为所有的工具, data, 计算能力存在于云或组织的数据中心中, 你可以和你的团队一起工作, 无论你在哪里.
通过指定团队成员的访问级别来安全地协作, 包括阅读, 写, 以及执行特权. 利用平台的评论系统集中讨论重要的基因组区域. 这些资源都是由工程和研究支持和不断增长的, 全球用户社区.
安全性和遵从性
七桥和您一样重视数据和结果的安全性. k8彩乐园官方免费下载平台的各个方面都是为处理机密患者信息而设计的,并符合管理健康记录的所有标准.
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基础设施
平台可在虚拟私有云中运行, 本地高性能计算环境, 或者两者的混合.
七桥平台是唯一一个与最大的公共基础设施提供商(亚马逊网络服务)合作的主要生物医学数据分析平台, 阿里巴巴, 微软Azure和谷歌云. 这意味着您可以将数据存储在一个云上,并将您的工具和研究问题带到数据中.
七桥平台是使用混合云的使能技术——您可以在本地构建管道并分析数据, 但是,当您需要更强大的计算资源或当您的本地基础设施任务过重时,请使用云. 《纲要》不变, 因此,您可以跨不同的基础设施在熟悉的环境中工作. 通过k8彩乐园官方免费下载帮助开发的通用工作流语言,在不同位置之间移动工具和管道变得很容易.
可伸缩性
通过弹性地扩展计算实例的数量和类型(除了优化并行运行的管道外),可以在七桥平台上运行的执行次数或分析的数据量没有限制.
此外,弹性伸缩还显著减少了任何给定管道的处理时间. 例如,平台可以完成GATK 2.3精简版全基因组管道在大约5小时内完成-比在单个基于云的节点上执行的典型执行速度快两倍多.
应用程序和工作流
七桥平台拥有一个完整的生物信息学工具和工作流程库. 七桥大学的生物信息学家认为 550个工具和工作流,确保始终可用最新版本.
了解更多可用信息 工具.
可视化
该平台提供了一套完全可定制的可视化工具. 它还包括互动的七桥 基因组浏览器 为合作调查而构建.
再现性
研究和临床试验取决于科学家复制结果的能力. 这就是为什么k8彩乐园官方免费下载在平台上的所有分析都是可重复的. 每一个工具, 版本, 参数, 分析中使用的数据会被自动记录下来,并且可以通过点击查看.
这个完整的记录允许您跟踪哪个执行产生了特定的输出文件. 它还允许任何人——从远程同事到期刊编辑——验证你的结果,而不需要分发代码或配置执行环境
SDK
七桥平台是完全可定制的.
使用七桥软件开发工具包(SDK)将您自己的软件和专有工具带到平台. 托管您选择的工具,并与其他“黄金标准”研究工具和管道无缝地执行它们. 使用您首选的数据集或从最大的公开可用数据库中选取样本.
学习 更多关于平台上的应用程序,以及如何添加自己的应用程序.
API
平台可以通过七桥实现自动化 应用程序编程接口(API) – upload and manage data; configure and initiate pipeline executions; and explore and download the results.
将平台与更广泛的系统和工作流程集成, 包括LIMS, 测序机器, 分析包(e.g., R, Java, 木星实验笔记本, 和Python),), 以及端到端的数据分析诊断报告服务.
精度
生物数据的准确分析是七桥和k8彩乐园官方免费下载所有客户的首要任务. 该平台的每个功能一起工作,以确保您的结果是无错误的. 该平台使用最先进的生物信息工具并实施最佳实践管道. 而且,当需要在准确性和速度之间进行权衡时,k8彩乐园官方免费下载总是确保前者. 最后, k8彩乐园官方免费下载的研发团队不断改进最准确的检测变异的方法:图谱基因组参考.
图基因组
七桥 伯爵™Suite包括用于下一代测序(NGS)数据二次分析的生物信息学工作流程和工具, 基于泛基因组图的参考,以揭示整个种群的更深入的见解.
七桥的伯爵是一个自我改进的系统,它使用图形而不是一串碱基来表示和分析基因组信息. 它使科学家能够大量压缩数据,从而以前所未有的规模进行操作. 这是一种非常精确的检测个体遗传变异的方法, 随着每一个新的序列添加到图中,这种准确性会提高. 它还提供了个体基因组序列的完全匿名性.
了解更多“七座桥” 图基因组 工具套件.