概述

利用基因组数据的生物技术公司可以通过将生物信息学流程从业务流程中分离出来来降低风险,并大大加快上市时间. 而不是花9到12个月的时间建立自己的部门, 集群, 软件过程, 和存储, 相反,公司选择了七桥,这意味着他们的生物信息学解决方案的启动和运行速度比他们准备第一个测序库的速度还要快.

分子标记

正欲 (BD)的科学家们开始着手消除现代RNA测序中最大的痛点之一:不仅仅是理解 哪一个 转录本被表达,但精确计数 有多少 在给定的细胞中表达.

而传统的RNA-Seq通常用于转录本定量,BD分子索引TM Kit部署了一种新型分子标记解决方案. 这使得研究人员能够在扩增和测序之前唯一地标记每个RNA分子, 从而导致高度准确的量化结果. 标签允许在测序后重复数据删除, 这意味着生物学家可以精确地重建原始样本中存在的转录本的确切数量.

然而,对于BD来说,新型化学只是一个开始. 他们也需要顾客, 准确的, 以及易于使用的生物信息学软件来解释标签背后的含义.

开发、交付、更新和支持生物信息工具

最初,BD通过可下载的二进制文件交付他们的定制工具. 然而, 他们发现很难支持,并创造了一个不那么引人注目的客户体验. 通过这种方法, 用户在安装这些工具时遇到了麻烦, 在本地机器上运行它们通常是一个缓慢的过程. 此外, 事实证明,让客户使用提供关键错误修复的最新版本非常困难, 而且,在世界各地的各种系统上支持安装是昂贵的. 经过全面的市场调研, BD决定,服务客户的最佳方式是与七桥合作,大规模交付他们的生物信息工具, 通过云.

为BD用户定制的基于云的门户

7个桥梁和BD合作确定如何最好地交付他们的定制工具.  这些团队共同确定,为BD的用户定制门户是最优的. 将这些工作流放在 七桥平台 意味着BD可以专注于质量改进, 即时更新每个人到他们的工具的最新版本, 并完全消除他们的软件支持负担.

七座桥团队首先使用BD的现有工具. 第一个, 在理解工具如何运作的过程中, 研究小组不仅发现了它们目前的功能, 但也对如何提高他们的表现提出了建议. 接下来,团队成为了k8彩乐园官方免费下载成熟的内部客户 软件开发套件 (SDK)——基于开源的公共工作流语言——允许任何人轻松地将他们的工具和工作流移植到七桥平台上.然后,BD将项目交给七座桥的前端和后端工程团队. 最后,前端团队为BD用户准备了定制门户.该门户允许生物学家轻松地请求访问 七桥平台 并将他们的数据直接加载到一个充满最佳实践工作流的项目中.

结论

科学家们正在通过选择七座桥作为他们的生物信息学解决方案来加速研究和分析项目. 通过与七桥的科学和生物信息学团队合作,团队用户能够利用先进的定制工具和工作流程, 这样他们就可以专注于手头的科学. 在云端交付的先进生物信息学工作流程提供了最新的大规模分析解决方案. 像双相障碍, 你可以通过最佳实践工作流程来提高你的研究水平, 一流的用户支持, 以及来自七桥平台的专业知识.